การคัดแยกหนังสือ เป็นกระบวนการหนึ่งของการจัดเรียงหนังสือ เพื่อนำขึ้นชั้นให้บริการ  โดยการที่เจ้าหน้าที่นำหนังสือที่ผู้ใช้บริการ นำมาคืนที่งานยืม-คืน รวมทั้งรวมรวบหนังสือที่ผู้ใช้ อ่านหรือใช้เสร็จแล้วที่อยู่ตามโต๊ะ มารวมกัน เพื่อนำหนังสือเหล่านั้น มาคัดแยกที่ห้องคัดแยก แล้วจึงนำหนังสือเข้าชั้นพักของเจ้าหน้าที่แต่ละคนที่รับผิดชอบในการนำหนังสือแต่ละหมวดหมู่ขึ้นชั้นต่อไป

ขั้นตอนการแยกหนังสือ

1. นำหนังสือมาแยกออกตามภาษาของการเขียนหนังสือหรือทรัพยากรสารสนเทศนั้นๆ เช่น แยกเป็นภาษาไทย ภาษาอังกฤษ เป็นต้น
2. แยกประเภทของหนังสือจากข้อ 1 ออกเป็นประเภทของเอกสาร ได้แก่ วิทยานิพนธิ์  วารสาร นวนิยาย เป็นต้น
3. นำหนังสือทั่วไปภาษาไทย ภาษาอังกฤษ  จำแนกออกเป็นหมวดย่อยๆแล้วจึงนำเข้าชั้นพักหนังสือของเจ้าหน้าที่แต่ละคนเพื่อรอให้เจ้าหน้าที่แต่ละคนมาเรียงเข้าตามชั้นหนังสือต่อไป